La deuxième guerre mondiale prend fin. Mais les Russes et les Allemands se font toujours face dans une ville ravagée par la guerre. Le joueur entre dans la peau d'un tireur d'élite allemand recruté par l'OSS (ancienne CIA) pour mener à bien des missions capitales contre le NKVD dans ce qui peut être considéreé comme la première bataille de la guerre froide.

Sniper Elite est basé sur deux types de gameplay étroitement liés : Infiltration et Snipe.
L'art de l'infiltration (vue à la 3ème personne) : pour éviter tous les dangers dans une ville en plein conflit, le joueur doit s'infiltrer et trouver la meilleure position de tir.
L'art du snipe (vue à la 1ère personne) : varie selon divers éléments - la distance, la respiration, le vent, le bon timing, et les techniques des pro : retenir sa...