L'histoire de Prince of Persia Revelations débute quelques années après la fin de Prince of Persia : Les Sables du Temps. Le Prince, de retour à Babylone, est hanté par une créature surnaturelle qui cherche à le détruire.

Contraint de vivre comme un fugitif, il va chercher conseil auprès d’un sage. Ce dernier lui révèle que ce sont ses actions qui ont engendré la créature : le Dahaka. En effet en empêchant la destruction du palais du Sultan, le Prince a créé une faille dans le cours du temps. Dans Prince of Persia Revelations, le Dahaka tente maintenant de réparer ce problème en mettant fin à la vie du Prince.

Le Prince découvre que le seul moyen qu’il a de s’en sortir est de se rendre sur le lieu d’apparition des Sables du Temps, de trouver le moyen de voyager dans le temps et...