Il existe des choses que nous sommes supposés ignorer : les organisations secrètes qui opèrent au plus haut niveau gouvernemental. Leurs agents peuvent s'introduire sur le territoire ennemi, mener leur mission et se retirer sans que personne ne se soit aperçu de rien. De telles personnes sont connues sous le nom de "SplinterCell".

Sam Fisher fait partie de ces individus. Le soldat vétéran a été rappelé de sa retraite et recruté par le Third Echelon, un groupe secret du gouvernement américain déterminé à mettre un terme aux agissements d'un dangereux dictateur qui utilise le terrorisme pour semer le chaos sur la planète.

Se déroulant dans un futur pas si lointain, SplinterCell vous place dans la peau de Sam, surentraîné aux techniques de combat mortelles, et passé...