A partir du moment où vous avez rencontré Aria au cours de l'aventure, vous pouvez débloquer les personnages de Spectral Souls suivants de la manière suivante :
Hiro : Terminer l'ancienne route 4.
Rose : Terminer l'ancienne route 4.
Yunellia : Terminer l'ancienne route 4.
Accéder aux différentes fins
Mauvaise fin : Atteindre le route 5 et combattre Mother Genome avant d'avoir rencontré Jadore.
Fin normale : Battre Mother Genome après avoir rencontré Jadore ou combattre tous les génomes humains puis Edward sans avoir battu les 50 étages de l'Abyssal Gate.
Vraie fin : Activer tous les drapeaux, recruter tous les personnages, terminer l'Abyssal Gate puis combattre Edward et les combats qui s'en suivent.