Il existe quatre Pixls cachés, mais ne sont pas indispensables pour la fin du jeu.

Barry :

Battre Francis au chapitre 3-4 et après allez chercher Barry derrière un buisson du chapitre 3-1.

Barry peut former des champs de force.

Dashell :

Il se trouve au bout du Flipside Pit of 100 trials.

Dashell fait courir très vite le personnage.

Piccolo :

Dès que vous avez placé le sixième Pure Heart, allez aider Merlee puis parler à Merluvlee, Bestovious, Watchitt, Merluminia et pour finir à Merlee de nouveau. A la fin il vous donne la clef de Random House où se trouve Piccolo.

Ce Pixl permet de restaurer les altérations du statut d'un personnage, mais peu aussi découvrir des événements nouveaux.

Tiptron :

Dès que vous avez fini le jeu, vous pourrez acheter Tiptron chez Francis au prix de 999 pièces.

Pour avoir la vue 3D à l'infinie il faut finir Flopside Pit of 100 Trails deux fois, puis vous récupérerez une carte Mario qui vous permettra de passer de la 2D à la 3D sans restriction.